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Aus IDES Wiki (Integriertes Datenmanagement für die digitale Erschließung zoologischer und paläontologischer Sammlungsbestände)
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[[Datei:JME Macrosemimimus fegerti bei der Präparation.JPG|200px|right|Macrosemimimus fegerti bei der Präparation © Jura-Museum Eichstätt'']]
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[[Datei:ZSM Alkoholsammlung.jpg|200px|right|''Alkoholsammlung  © Zoologische Staatssammlung München'']]
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[[Datei:BSPG Digitalisierungsstation.jpg|200px|right|Digitalisierungsstation  © Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie'']]
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<big>'''I'''ntegriertes '''D'''atenmanagement für die digitale '''E'''rschließung zoologischer und paläontologischer '''S'''ammlungsbestände (IDES)
 
<big>'''I'''ntegriertes '''D'''atenmanagement für die digitale '''E'''rschließung zoologischer und paläontologischer '''S'''ammlungsbestände (IDES)
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Ziel von IDES ist der Aufbau einer leistungsfähigen Informationsinfrastruktur zur Sammlungsdigitalisierung an vier Einrichtungen der [http://www.snsb.de Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns] (SNSB). Sie dient der gemeinsamen Erschließung der dort vorhandenen Sammlungsobjekte aus den Bereichen Paläontologie und Zoologie. Die dezentrale Datenmobilisierung, zentrale Datenorganisation, -archivierung und -publikation wird dabei durch das [http://www.snsb.info SNSB IT Center] koordiniert.
  
Ziel des Vorhabens ist der Aufbau einer leistungsfähigen Informationsinfrastruktur an vier örtlich getrennten Einrichtungen der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB) zur gemeinsamen Erschließung der dort vorhandenen Sammlungsobjekte aus den Bereichen Paläontologie und Zoologie. Die ichthyologischen Sammlungen der vier Einrichtungen ZSM, SAPM, BSPG und JME gehören zu den bedeutendsten ihrer Art weltweit. Im Rahmen des Vorhabens sollen Objekte der Fischgruppe Actinopterygii aus Europa und angrenzenden Meeren ab dem Erdzeitalter der Trias erschlossen werden, da diese die zurzeit am intensivsten beforschte Gruppe der Fische ist und gleichzeitig den Schwerpunkt der Sammlungsbestände bildet.
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Die ichthyologischen Sammlungen der [https://spm.snsb.de/ Staatssammlung für Paläoanatomie München] (SNSB-SPM), [http://www.palmuc.de/bspg/ Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie] (SNSB-BSPG), [http://www.zsm.mwn.de Zoologische Staatssammlung München] (SNSB-ZSM), und [http://www.jura-museum.de Jura-Museum Eichstätt] (SNSB-JME) gehören zu den bedeutendsten weltweit.  
  
Im Rahmen des Vorhabens sollen (a) mobile Arbeitsstationen zur Digitalisierung von verschiedenartigen Sammlungsobjekten (Fossilien, Fischskelette, Alkoholpräparate, Gewebeproben) samt beiliegender Dokumente (Fundortangaben, Beschreibungen usw.) etabliert werden, (b) die strukturierte Erfassung von Standardinformationen zu insgesamt 50.000 Objekten und 10.000 Digitalisaten im relationalen Datenbanksystem der Diversity Workbench (DWB) ausgebaut werden und (c) ein integriertes Datenmanagement ausgehend von der Bildaufnahme und dezentralen Datenerschließung in Sammlungsräumen bis zur zentralen Speicherung, Archivierung und Publikation an einem Datenarchiv entwickelt werden.
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Im Rahmen des Vorhabens werden Objekte der Fischgruppe Actinopterygii aus Europa und angrenzenden Meeren ab dem Erdzeitalter der Trias digital erschlossen, da diese die zurzeit am intensivsten beforschte Gruppe der Fische ist und gleichzeitig den Schwerpunkt der Sammlungsbestände bildet. Das Projekt IDES hat fünf [[Teilprojekte]].
  
Der Datenfluss schließt die Anbindung der Datenquellen an verschiedene Webschnittstellen und Wrapperinstallationen ein, so dass die Daten überregional über nationale und internationale Internetportale verfügbar sein werden (siehe dazu Graphik zum IDES Datenfluss). Für die Präsentation der Bestände wird ein BioCASe-Portal eingerichtet.
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Die Fachdaten werden über einen integrierten Datenfluss für nationale und internationale Wissenschaftsnetzwerke bereitgestellt, z. B. für GBIF (
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'''[[IDES datasets accessible by GBIF]]''') mit den SNSB als [https://www.gbif.org/publisher/0674aea0-a7e1-11d8-9534-b8a03c50a862 GBIF Data Publisher], für [https://bionomia.net Bionomia] und für nationale Portale, wie sie im Rahmen von [http://wiki.binhum.net BiNHum], [https://www.gfbio.org/ GFBio] und [https://www.nfdi4biodiversity.org/de/ NFDI4Biodiversity] entwickelt werden.
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Die aufgebauten [[IDES Digitalisierungsstationen und Arbeitsprozesse]] werden dokumentiert.
  
Nach Projektablauf wird die Datenerschließung an den ichthyologischen Sammlungen der SNSB durch die als Projektleiter beteiligten Sammlungskuratoren, Datenmanager und ihre Mitarbeiter fortgesetzt werden. Das institutionelle Datenrepositorium am SNSB IT-Zentrum garantiert ein auf Nachhaltigkeit angelegtes Datenmanagement, Datenarchivierung und Bereitstellung. Das Datenhaltungs- und Managementsystem der Diversity Workbench wird bereits während der Projektlaufzeit an weiteren naturhistorischen Sammlungen Deutschlands, z. B. des Humboldt-Ringes (siehe ***), eingeführt.
 
  
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''Integrated data management for mobilisation and digitalisation of zoological and palaeontological collections (IDES)''
 
''Integrated data management for mobilisation and digitalisation of zoological and palaeontological collections (IDES)''
  
''The project IDES aims to set up a high performing information infrastructure which will be commonly used by four research collections belonging to the Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns (SNSB). The worldwide unique ichthyological collections are housed in separate buildings in Munich and Eichstätt and belong to four administrative independent institutions (Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, Jura-Museum Eichstätt, Staatssammlung für Anthropologie und Paläoanatomie München and Zoologische Staatssammlung München). IDES will mobilise and digitalise the data and metadata of Actinopterygii from Europe and adjacent seas, starting from the Mesozoic era (Trias) until collections of extant fishes. Mobile work stations with innovative imaging facilities will be established and adapted to the specific requirements of the various kinds of collection objects (dried collections of skeletons, wet collections, fossils, DNA and tissue collections) accompagnied by text information on paper documents with location data, descriptions etc. At the end of the project the data for more than 50.000 objects with 10.000 images will be accessible via the relational database system Diversity Workbench (DWB). This allows a sustainable and integrative data management and data flow starting with the imaging process, decentral data entry in the collection storage rooms until a central data archiving and data processing in close cooperation with the IT Center of the SNSB. The data flow includes the connexion of the data sources to various web interfaces, wrapper installations and the data publication in international data networks like GBIF, FishBase and FishNet 2.''
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''The project IDES aims to set up a high performing information infrastructure which will be commonly used by four research collections belonging to the Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns (SNSB). The worldwide unique ichthyological collections are housed in separate buildings in Munich and Eichstätt and belong to four administrative independent institutions (Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, Jura-Museum Eichstätt, Staatssammlung für Paläoanatomie München and Zoologische Staatssammlung München). IDES will mobilise and digitalise the data and metadata of Actinopterygii from Europe and adjacent seas, starting from the Mesozoic era (Trias) until collections of extant fishes. Mobile work stations with innovative imaging facilities will be established and adapted to the specific requirements of the various kinds of collection objects (dried collections of skeletons, wet collections, fossils, DNA and tissue collections) accompagnied by text information on paper documents with location data, descriptions etc. At the end of the project the data for more than 50.000 objects with 10.000 images will be accessible via the relational database system Diversity Workbench (DWB). This allows a sustainable and integrative data management and data flow starting with the imaging process, decentral data entry in the collection storage rooms until a central data archiving and data processing in close cooperation with the IT Center of the SNSB. The data flow includes the connexion of the data sources to various web interfaces, wrapper installations and the data publication in international data networks like GBIF, FishBase and FishNet 2.''
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[[Datei:DFG Logo.jpg|link=http://www.dfg.de/|50px|Logo der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG)]]
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Das Projekt "Integriertes Datenmanagement für die digitale Erschließung zoologischer und paläontologischer Sammlungsbestände" wird im Rahmen des [http://www.dfg.de/foerderung/programme/infrastruktur/lis/index.html LIS] Infrastrukturprogramms der Deutschen Forschungsgemeinschaft seit 2012 gefördert (GZ:KO 1682/5-1; MO 2350/1-1; OB 347/1-1; SCHL 567/6-1 und TR 290/5-1). Die Infrastruktur wird auch nach Projektende im Jahre 2016 aufrechterhalten und die Datenkuration fortgesetzt.
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Aktuelle Version vom 30. Juli 2023, 09:44 Uhr

Macrosemimimus fegerti bei der Präparation © Jura-Museum Eichstätt
Alkoholsammlung  © Zoologische Staatssammlung München
Digitalisierungsstation  © Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie


Integriertes Datenmanagement für die digitale Erschließung zoologischer und paläontologischer Sammlungsbestände (IDES)


Ziel von IDES ist der Aufbau einer leistungsfähigen Informationsinfrastruktur zur Sammlungsdigitalisierung an vier Einrichtungen der Staatlichen Naturwissenschaftlichen Sammlungen Bayerns (SNSB). Sie dient der gemeinsamen Erschließung der dort vorhandenen Sammlungsobjekte aus den Bereichen Paläontologie und Zoologie. Die dezentrale Datenmobilisierung, zentrale Datenorganisation, -archivierung und -publikation wird dabei durch das SNSB IT Center koordiniert.

Die ichthyologischen Sammlungen der Staatssammlung für Paläoanatomie München (SNSB-SPM), Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie (SNSB-BSPG), Zoologische Staatssammlung München (SNSB-ZSM), und Jura-Museum Eichstätt (SNSB-JME) gehören zu den bedeutendsten weltweit.

Im Rahmen des Vorhabens werden Objekte der Fischgruppe Actinopterygii aus Europa und angrenzenden Meeren ab dem Erdzeitalter der Trias digital erschlossen, da diese die zurzeit am intensivsten beforschte Gruppe der Fische ist und gleichzeitig den Schwerpunkt der Sammlungsbestände bildet. Das Projekt IDES hat fünf Teilprojekte.

Die Fachdaten werden über einen integrierten Datenfluss für nationale und internationale Wissenschaftsnetzwerke bereitgestellt, z. B. für GBIF (→ IDES datasets accessible by GBIF) mit den SNSB als GBIF Data Publisher, für Bionomia und für nationale Portale, wie sie im Rahmen von BiNHum, GFBio und NFDI4Biodiversity entwickelt werden. Die aufgebauten IDES Digitalisierungsstationen und Arbeitsprozesse werden dokumentiert.




Integrated data management for mobilisation and digitalisation of zoological and palaeontological collections (IDES)

The project IDES aims to set up a high performing information infrastructure which will be commonly used by four research collections belonging to the Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns (SNSB). The worldwide unique ichthyological collections are housed in separate buildings in Munich and Eichstätt and belong to four administrative independent institutions (Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie, Jura-Museum Eichstätt, Staatssammlung für Paläoanatomie München and Zoologische Staatssammlung München). IDES will mobilise and digitalise the data and metadata of Actinopterygii from Europe and adjacent seas, starting from the Mesozoic era (Trias) until collections of extant fishes. Mobile work stations with innovative imaging facilities will be established and adapted to the specific requirements of the various kinds of collection objects (dried collections of skeletons, wet collections, fossils, DNA and tissue collections) accompagnied by text information on paper documents with location data, descriptions etc. At the end of the project the data for more than 50.000 objects with 10.000 images will be accessible via the relational database system Diversity Workbench (DWB). This allows a sustainable and integrative data management and data flow starting with the imaging process, decentral data entry in the collection storage rooms until a central data archiving and data processing in close cooperation with the IT Center of the SNSB. The data flow includes the connexion of the data sources to various web interfaces, wrapper installations and the data publication in international data networks like GBIF, FishBase and FishNet 2.



Logo der Deutschen Forschungsgemeinschaft (DFG)

Das Projekt "Integriertes Datenmanagement für die digitale Erschließung zoologischer und paläontologischer Sammlungsbestände" wird im Rahmen des LIS Infrastrukturprogramms der Deutschen Forschungsgemeinschaft seit 2012 gefördert (GZ:KO 1682/5-1; MO 2350/1-1; OB 347/1-1; SCHL 567/6-1 und TR 290/5-1). Die Infrastruktur wird auch nach Projektende im Jahre 2016 aufrechterhalten und die Datenkuration fortgesetzt.


Turbomesodon  © Jura-Museum Eichstätt
Knochen von Seranus cabrilla  © Staatssammlung für Paläoanatomie München
Knochen von Barbus barbus  © Staatssammlung für Paläoanatomie München
Belonostomus kochi mit Beutefisch Orthogonikleithrus hoelli © Jura-Museum Eichstätt
Gewebeproben  © Zoologische Staatssammlung München
Fossile Fische  © Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie
Fossiler Fisch  © Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie





SNSB IT Zentrum
Zoologische Staatssammlung München
Staatssammlung für Paläoanatomie München
Bayerische Staatssammlung für Paläontologie und Geologie
Jura Museum Eichstätt
Staatliche Naturwissenschaftliche Sammlungen Bayerns